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Dr.ssa Laginestra Maria Antonella

Curriculum Vitae

Data di nascita
03/10/1975
Qualifica

Biologo-Bioinformatico

Incarico attuale

Ricercatrice

Titoli di studio
  • 2022: Laurea Magistrale in International Bologna Master in Bioinformatics, Università di Bologna. Titolo Tesi: “Reverse engineering to infer gene regulatory networks in normal and tumor transcriptomes"
  • 2004: Laurea (vecchio ordinamento) in Scienze Biologiche, indirizzo Biomolecolare conseguita presso l’Università degli Studi di Pisa. Titolo Tesi: “Screening in vitro of some newly synthesized hydroxamic compounds for inhibitory activity on seven different matrixins (extracellular matrix metalloproteinases, MMPs)"
Altri titoli
  • 2013: Conseguimento del Dottorato di ricerca in Ematologia Clinica e Sperimentale ed
    Emopatologia (ciclo XXV) presso l’Università degli Studi di Bologna.
    Titolo Tesi: “microRNA Profiling in Peripheral T Cell Lymphomas”.
  • 2009: Specializzazione in Genetica Medica conseguita presso l’Università Degli Studi di Bologna. Titolo Tesi: "Genomic profiling study based on the Array SNPs technique in patients with Myelofibrosis"
  • 2006: Abilitazione all’esercizio della Professione di Biologo ottenuta presso l’Università degli Studi di Bologna. Iscritta all’Ordine Nazionale dei Biologi, provincia di Bologna.
Incarichi ricoperti
  • 01/09/2022 ad Oggi: Ricercatore presso Laboratorio di Oncologia Sperimentale, Istituto Ortopedico Rizzoli. Progetto: Analisi bioinformatica dei dati di RNA-Seq nei Sarcomi.
  • 01/02/2020- 08/312022: Contratto 15-octies presso il Laboratorio di Oncologia Sperimentale dell'Istituto Ortopedico Rizzoli. Progetto: Analisi bioinformatica dei dati di RNA-Seq nei Sarcomi.
  • 07/2016-04/2019: Contratto di collaborazione coordinata e continuativa presso il laboratorio di Patologia Molecolare, Dipartimento di Ematologia e Scienze Oncologiche “L. & A. Seràgnoli”, Università di Bologna. Progetto di ricerca: “Innovative approaches to the diagnosis and pharmacogenetic-based therapies of primary hepatic tumours, peripheral B and T-cell lymphomas and lymphoblastic leukaemias”.
  • 11/2015-02/2016: Contratto di collaborazione coordinata e continuativa presso L’unità di laboratorio di Ematoncologia Clinica, Istituto Europeo di Oncologia (IEO) di Milano. Progetto di ricerca: “Blastic Plasmacytoid dendritic cell neoplasm: from genomics to therapy”.
  • 11/2013-10/2015: Assegnista di ricerca presso il laboratorio di Patologia Molecolare, Dipartimento di Ematologia e Scienze Oncologiche “L. & A. Seràgnoli”, Università di Bologna. Progetto di ricerca: “Sequenziamento massivo del genoma per lo studio della patobiologia dei tumori ematolinfoidi”.
  • 01/2013-10/2013: Borsa di Studio erogata da ABSTE: “Associazione Bolognese Studi Tumori Ematologici” presso il laboratorio di Patologia Molecolare Dipartimento di Ematologia e Scienze Oncologiche “L. & A. Seràgnoli”, Università di Bologna. Progetto di ricerca: “Caratterizzazione genetico-molecolare dei linfomi a cellule T periferiche”.
  • 01/2010-12/2012: Vincitrice di Borsa di Studio per il Dottorato di Ricerca in Scienze Biomediche: Ematologia Clinica e Sperimentale ed Ematopatologia, Università di Bologna. Progetto di ricerca: microRNA Profiling nei Linfomi a Cellule T Periferiche.
  • 12/2004-11/2005: Borsa di studio presso il Dipartimento di Biochimica dell'Università di Pisa. Attività di ricerca: "Caratterizzazione del ruolo delle metalloproteinasi nella matrice extracellulare".
Lingue

Italiano: madrelingua
Inglese: ottimo

Tecnologie

Competenze Bioinformatiche:

  • Sistemi operativi: UNIX (Linux e OSX), Microsoft Windows
  • Linguaggi di programmazione: Bash, R, Python, Perl
  • Utilizzo di pipeline specifiche per l’analisi dati di Whole Exome sequencing, RNA-sequencing, Targeted Sequencing
  • Uso del pacchetto R (Bioconductor) per l’analisi statistica e la visualizzazione.

Competenze Biologia Molecolare:

  • Sequenziamento dell'intero esoma (WES) e dell'intero trascrittoma (RNA-seq): preparazione delle librerie, quantificazione (Picogreen, RealTime e Qubit) e validazione (Bioanalyzer); piattaforme di sequenziamento NextSeq 500 e MiSeq (Illumina).
  • Profilazione dell'espressione genica e dei microRNA con tecnologia Affymetrix e Illumina (DASL per campioni FFPE).
Attività scientifica

Lavori listati su PubMed