L'Istituto Ortopedico Rizzoli si avvale della collaborazione di case di cura in convenzione, ubicate a Bologna, per la propria attività di ricovero e per interventi chirurgici in regime di SSN. Grazie a queste convenzioni l'Istituto ha ampliato la disponibilità di sale operatorie e di posti letto, consentendo maggiore fluidità delle liste d'attesa e, quindi, minori tempi di attesa per il ricovero.

Le strutture attualmente convenzionate sono le seguenti:

• Ospedale privato accreditato Villa Laura: Via Emilia Levante n°137, 40139 Bologna (Centralino: 051-6246411; Guardiola Infermieri: 051-6246462 e 051-6246461; Studio Medici: 051-6246481 e 051-6246482). Dedicati al Rizzoli sono n°20 posti letto al secondo piano della clinica. Le divisioni che, allo stato attuale, operano in convenzione sono: Clinica Ortopedica e Traumatologica I (direttore prof. Cesare Faldini), Clinica Ortopedica e Traumatologica III a prevalente indirizzo oncologico (direttore prof. Davide Donati), Ortopedia Bentivoglio (direttore dr. Massimiliano Mosca), Chirurgia Protesica (direttore prof. Francesco Traina). Le sedute operatorie IOR sono quotidiane e, fisicamente, due sono le sale dedicate al Rizzoli.
• Ospedale Villa Chiara: Via Porrettana n°170, 40033 Casalecchio di Reno, Bologna (Chirurgia: 051-2984940; Reparto: 051-2984980). Le divisioni che, allo stato attuale, operano in convenzione sono: Clinica Ortopedica e Traumatologica II (direttore prof. Stefano Zaffagnini), Chirurgia Vertebrale (direttore prof. Alessandro Gasbarrini), Ortopedia e Traumatologia Pediatrica (direttore dr. Gino Rocca), Ortopedia Bentivoglio (direttore dr. Massimiliano Mosca).